生物安全柜主要用于保护进行生物实验的操作人员。对于一些进行生物培养和菌类培养实验常常会产生一些污染物，这些污染物不能随便进行排放，生物安全柜的出现很好的解决了这一问题。正确的使用生物安全柜可以保护实验者的同时也能很好的解决生物污染的排放问题。当然这一切是建立在正确选购和使用的前提下，安全柜有很多种，包括生物安全柜和超净工作台。

生物安全柜的选择类型取决于生物实验类型：

1、实验中如果只有微生物样品，那么可以使用基本类型的生物安全柜；

2、如果生物实验中涉及了微生物样品和微量化学试剂(非腐蚀性)，使用装备外排管道的安全柜是必要的。因为HEPA过滤器并不能有效过滤清除化学气体，如果不能外排，将对实验室内工作人员和环境造成威胁； 

3、如果生物实验中涉及了细胞毒素类药物，例如各类癌症治疗药物，必须使用的细胞毒素安全柜。 

生物安全柜与通风柜/超净工作台都属于安全柜类别，但通风柜和超净工作台不属于生物安全柜，因为两种安全柜不可在涉及微生物的实验中使用。

超净工作台是为了保护实验品或产品而设计的，通过吹过工作区域的垂直或水平层流空气防止实验品或产品受到工作区域外粉尘或细菌的污染。一旦微生物样品放置于工作区域，层流空气将把带有微生物介质的空气吹向前台工作人员而产生危险。